Alphen aan den Rijn is over het algemeen vanuit alle richtingen goed bereikbaar met de auto. De belangrijkste toegangswegen zijn de volgende:

• Vanuit het noorden (komende vanaf Amsterdam, Schiphol) is Alphen aan den Rijn het makkelijkste te bereiken door vanaf de A4 vlak voor Knooppunt Burgerveen afrit 4 bij Leimuiden te pakken, en vanaf daar de borden richting Alphen aan den Rijn te volgen. Je wordt dan over de N207 richting Alphen geleid.
• Vanuit het westen (vanaf Leiden, maar ook Den Haag via de A4) kan het beste ter hoogte van Zoeterwoude de N11 richting Alphen gevolgd worden. Op dit traject is de N11 niet meer de oude provinciale weg langs de Oude Rijn, maar een vierbaans autoweg, welke voor een vlotte verbinding zorgt.
• Vanuit het oosten (komende vanaf Bodegraven of Utrecht) is het het handigst om ter hoogte van Bodegraven de A12 te verlaten en vanaf daar de N11 richting Alphen aan den Rijn te volgen.
• Komende vanaf het zuiden (Rotterdam) zijn er twee mogelijkheden. Allereerst kan bij Gouda de A12 verlaten worden om via Waddinxveen en Boskoop verder te rijden over de N207 richting Alphen aan den Rijn.
  Als alternatief is het mogelijk om door te rijden richting Bodegraven en daar de snelweg te verlaten om de N11 richting Alphen aan den Rijn te volgen.
  Op dit moment maakt het qua tijd niet veel uit of er via Gouda of via Bodegraven wordt gereden. Wanneer in het voorjaar van 2004 de N11 als vierbaansweg gereed komt is het goed mogelijk dat de verbinding via Bodegraven sneller wordt, simpelweg omdat een autoweg sneller rijdt dan een provinciale tweebaansweg dan de huidige N11 Bodegraven <> Alphen of de tweebaans N207 van Gouda richting Alphen.